关于粮食问题还会涉及到另一个层面的思考，那就是用玉米、甘蔗等农作物生产的生物燃料。作为增强能源安全、减少温室气体排放的解决方案之一，生物燃料工业受到一些国家的广泛推崇。巴西蔗糖工农业联盟最近表示，巴西乙醇燃料产业快速发展，预计今后6年内将获得170亿美元投资。
据《圣保罗州报》报道，虽然国际上的一些批评声音认为，发展生物燃料影响粮食安全，但巴西还是不断吸引到新的投资。一些新建的乙醇燃料工厂陆续投产，现在巴西已有84家乙醇生产厂。
巴西法律规定，汽油中必须添加25%的乙醇燃料，巴西国内生产的82%的汽车都采用了混合燃料发动机，可以使用普通汽油也可以使用乙醇，或者两种燃料的混合物。由于巴西用于生产乙醇燃料的甘蔗种植面积只占全国可耕地面积的1%，所以巴西官方认为，发展乙醇燃料不但对粮食安全没有影响，而且能帮助贫困农业人口增加收入。
据统计，2000年到2007年间，全球生物燃料的产量增长了两倍多，但生物燃料在运输燃料总消耗中的比例仍不到3%。当前生物燃料的生产主要集中在美国、巴西和欧盟。和巴西不同，美国主要利用玉米生产燃料乙醇；欧洲国家则以发展生物柴油为主，主要原料是油菜子。
许多人认为，近几年来全球粮食价格上涨与当前的生物燃料生产直接相关，特别是玉米价格。目前，生物燃料对粮食价格有多大影响，各方说法不一。联合国粮农组织去年年底说，当前的生物燃料发展计划将使食品成本上升10%到15%。